umeščanje angleško docking
Računalniška metoda za napoved najugodnejše umestitve ene molekule v drugo v kompleksu, ki pri tem nastane. Vhodni podatki za računalniški algoritem so strukture posameznih sestavnih delov kompleksa ter morebitne dodatne omejitve, pridobljene z drugimi eksperimenti, na podlagi katerih s pomočjo različnih načinov iskanja (sistematično iskanje, simulacije molekulske dinamike, genetski algoritmi) in vrednotenja izračunamo najverjetnejše strukture kompleksov. V grobem ločimo dva osnovna tipa umeščanja, in sicer umeščanje majhnih organskih ali anorganskih molekul na makromolekulo (protein ali nukleinsko kislino) in umeščanje ene makromolekule na drugo (modeliranje kompleksov makromolekul).



Vir: Mali leksikon biokemije in molekularne biologije - Slovensko biokemijsko društvo

Komentiraj slovarski sestavek